在最新发布的2024QS世界大学学科排名中，日本高校共有436个学科入榜，其中东京医科齿科大学的牙科学专业排名最高，位居全球第4位；其余进入榜单前10位的学科均来自于东京大学。
日本东京大学QS世界大学学科排名
东京大学有46个学科进入榜单Top100，其中4个学科更是进入榜单前十位：艺术史位居全球第6，现代语言学全球第7，物理学与天文学全球第9，石油工程全球第10。
日本京都大学QS世界大学学科排名
京都大学共有39个学科进入2024QS世界大学学科排名Top100，排名最高的是古典文学与古代史，位居全球第20位。
大阪大学QS世界大学学科排名
大阪大学共有7个学科位居2024QS世界大学学科排名前100位：
物理学与天文学第45位
化学第58位
现代语言学第76位
生物科学第84位
材料科学第87位
古典文学与古代史第 51-100位
牙科学第51-100位
日本东京工业大学QS世界大学学科排名
东京工业大学有12个学科进入世界百强，艺术史排名全球第19位。
日本东北大学QS世界大学学科排名
日本东北大学共有5个学科进入2024QS世界大学学科排名前100，分别是：
材料科学第50位
物理学与天文学第50位
机械、航空及制造工程第85位
解剖与生理学第51-100位
牙科学第51-100位
九州大学
九州大学的矿物与采矿工程专业位居全球第51-70位
名古屋大学
名古屋大学有2个学科进入全球前100：的物理学与天文学专业位居全球第68位；发展学第51-100位
北海道大学
北海道大学的农业与林业居全球第88位，化学全球第95位
日本早稻田大学QS世界大学学科排名
早稻田大学的现代语言学排名最高，位居全球第42位
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